睡一觉起来浑身发热头疼可能是由偏头痛、上呼吸道感染、流行性感冒等原因引起的，疾病详情及治疗方式如下：

1.偏头痛：偏头痛是一种神经血管性头痛，症状包括头痛、恶心、呕吐、光、声敏感等。偏头痛可能在睡眠中触发，导致头痛和不适感的出现。此种情况下，应休息，避免过度用眼和情绪波动，避免诱发偏头痛发作。治疗方式包括预防治疗和急性发作治疗，预防治疗常用药物包括美托洛尔、依托咪酯等，急性发作治疗常用药物包括布洛芬、曲普坦等。

2.上呼吸道感染：上呼吸道感染是由冷热变化等因素引起的，常见症状包括发热、头痛、身体疲乏、咳嗽、打喷嚏等。治疗方法包括多休息、多饮水、适量补充维生素C等，对于症状明显的患者可在医生指导下服用退烧药如对乙酰氨基酚或布洛芬等。

3.流行性感冒：流行性感冒是由流感病毒引起的急性呼吸道感染，症状与上呼吸道感染相似但较为严重，常见症状包括高热、头痛、肌肉疼痛、咳嗽等。治疗方法包括多休息、多饮水、适量补充维生素C等，对于症状明显的患者可在医生指导下服用抗病毒药物如奥司他韦或扎那米韦等。

除以上相对常见原因及治疗方式外，还有其他的可能性疾病，比如高血压、脑卒中、脑膜炎、脑梗死、脑出血、脑肿瘤等。如果症状持续或加重，建议及时就医。注意用药需遵医嘱。