山莨菪碱和东莨菪碱是两种化学结构不同的药物，但都具有镇静、催眠、抗胆碱能等作用。

山莨菪碱和东莨菪碱都属于生物碱类药物，它们的化学结构不同。山莨菪碱是一种季铵盐型生物碱，分子式为C17H23NO3，分子量为289.37，而东莨菪碱则是一种醇型生物碱，分子式为C17H21NO4，分子量为303.35。由于结构的差异，两种药物在药理作用、代谢途径等方面也有一些不同。

首先，山莨菪碱和东莨菪碱都是镇静、催眠、抗胆碱能等作用的药物，但它们的药效和毒性有所不同。山莨菪碱的作用主要集中在中枢神经系统，它可以产生镇静、催眠、抗惊厥、肌肉松弛等作用，但毒性较大，容易引起中毒。而东莨菪碱的作用则更加全面，不仅可以产生类似山莨菪碱的作用，还可以增加心肌收缩力、扩张血管等，但毒性相对较小。

其次，山莨菪碱和东莨菪碱的代谢途径也不同。山莨菪碱主要在肝脏中经过羟化、氧化等代谢，而东莨菪碱则主要在肝脏中通过葡萄糖醛酸途径代谢。这也导致了两种药物在药代动力学方面的差异。

需要注意的是，山莨菪碱和东莨菪碱虽然都具有一定的药理作用，但由于毒性较大，在使用时必须严格按照医生的指示使用，避免出现过量使用等情况。同时，由于两种药物代谢途径的不同，也可能会导致两种药物在不同人群中的效果差异较大，因此使用时需谨慎。