男生器官上长了小水泡可能是由多种原因引起的，常见的包括病毒感染、过敏反应和良性病变。

1. 病毒感染可能是由单纯疱疹病毒引起的。这种病毒可以通过性接触或口唇接触传播。感染后，男性会在阴茎、龟头或阴囊上出现水疱、瘙痒、灼热和疼痛等症状。此外，病毒感染还可能造成打嗝、头痛、发热和全身不适等症状。

2. 过敏反应可能是由某些化学物质、药物或材料引起的。过敏反应通常会在接触后几小时或几天内出现症状，包括阴茎上出现红肿、疼痛和小水泡等症状。过敏反应还可能伴随皮肤瘙痒、疹子、痒眼和喉咙痒等症状。

3. 良性病变可能是由黄体瘤引起的。黄体瘤是一种良性的生殖系统肿瘤，通常发生在10岁至30岁之间的男性。患者可能会在阴茎、龟头或阴囊上出现疼痛和水疱等症状。此外，黄体瘤还可能导致男性月经不调、乳房胀大和性功能障碍等症状。

除以上相对常见的原因之外，还有其他可能的原因，比如皮肤病、真菌感染、淋病等。如果男性出现了阴茎上小水泡的症状，应尽快到医院进行检查，以确定病因并采取相应的治疗措施。