多囊肾有结石一般是由多囊肾病等原因引起的，可采用保守治疗、药物治疗和手术治疗等方式进行治疗，详情如下：

1. 保守治疗：适用于结石较小、无症状或症状轻微的患者。这种治疗方式主要是通过改变生活方式和饮食习惯来预防和减少结石的形成。例如，增加饮水量、限制摄入高盐、高蛋白和高嘌呤食物等。保守治疗适用于结石较小，没有引起严重疼痛或并发症的患者。

2. 药物治疗：适用于结石较大或有症状的患者。一些药物可以帮助溶解结石或减少结石的形成。例如，利尿剂能够增加尿液排出，减少结石的堆积；碱性药物可使尿液碱化，从而减少尿酸结石的形成。药物治疗适用于结石较大或有症状的患者，但需要注意药物的副作用和适应症。

3. 手术治疗：适用于结石较大、有严重症状或并发症的患者。手术治疗包括射频消融、经皮穿刺引导碎石术、经皮肾镜碎石术等。手术治疗适用于结石较大、有严重症状或并发症的患者，可以有效去除结石及减轻症状。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如透析治疗适用于肾功能严重受损的患者，肾移植适用于肾功能衰竭的患者，但这些治疗方式一般在多囊肾有结石的情况下较少使用。