先天性甲状腺功能低下症一般是由甲状腺发育异常、甲状腺激素合成障碍等原因引起的，可采用甲状腺激素替代治疗、手术治疗和药物治疗等方式进行治疗，详情如下：

1. 甲状腺激素替代治疗：当患者甲状腺功能低下时，甲状腺激素替代治疗是最常用的治疗方法。这种治疗方式是通过口服甲状腺激素药物，如甲状腺素替代剂（如左甲状腺素）来补充体内甲状腺激素的不足。甲状腺激素替代治疗适用于所有患者，无论年龄或病情的严重程度。

2. 手术治疗：对于一些甲状腺发育异常或甲状腺功能低下严重的患者，手术治疗可能是必要的。手术治疗通常包括甲状腺切除术或甲状腺部分切除术，以去除异常的甲状腺组织或提高甲状腺激素的合成能力。手术治疗适用于那些存在甲状腺疾病引起的明显结构异常或功能障碍的患者。

3. 药物治疗：除了甲状腺激素替代治疗外，某些患者可能需要辅助药物治疗。例如，对于合并有心脏病或糖尿病的患者，可能需要使用相应的药物进行治疗。药物治疗的使用应该根据患者具体的病情而定，需要由医生进行评估和指导。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如光疗和针灸等，适用于一些特殊情况或辅助治疗。这些治疗方式的具体应用需要医生根据患者个体情况进行判断和决定。