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协和医学院的综合实力更好。协和医学院内科系统综合实力全国最强。
北京协和医学院是中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会直属的唯一一所重点医科大学,与中国医学科学院融为一体,是全国医学科学学术中心和综合性科研机构。“卓越博士教育培养计划”试点高校是我国首批世界一流学科建设高校。北京协和医学院于1917年由美国洛克菲勒基金会创办,1919年10月开始八年制医学本科。是中国最早开设八年制临床医学专业和护理本科教育的医学院,被誉为中华医学堂。
华西医院是中国西部地区疑难危重疾病的国家级诊疗中心。是世界上最大的综合性单点医院,拥有中国最大的医学检验中心,被美国病理学家协会整体认可。2014年,中国医学科学院医学信息研究所发布“中国医院科技影响力排名”,华西医院位列全国第一。
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