双肾多发结石的治疗方法包括：药物治疗、体外冲击波碎石术、经皮肾镜碎石术、开腹手术等。

对于双肾多发结石的治疗，首先要根据结石的大小、数量、位置及患者的年龄、体质等因素来进行个体化治疗。以下是常用的治疗方法：

1.药物治疗：适用于较小的结石（≤5mm），如磷酸钙结石、尿酸结石等。常用的药物有利尿剂、碱化尿液的药物、尿酸合成抑制剂等。

2.体外冲击波碎石术：适用于大于5mm的结石。此种治疗方法比较安全、简单、无创，但治疗效果可能与结石的位置、密度等因素有关。

3.经皮肾镜碎石术：适用于直径大于1cm的结石或者无法行体外冲击波碎石术的患者。经皮肾镜碎石术需要在局部麻醉下进行，通过膀胱和尿道插入内窥镜到达肾脏进行操作，对于结石位置较为靠近肾盂的患者，采用此种方法的治疗效果更佳。

4.开腹手术：适用于病情紧急（如伴有感染、出血等情况）或其他治疗方法失败的患者。

需要注意的是，治疗过程中需注意饮食和生活方式的调节。避免高盐、高糖、高脂肪、高蛋白的饮食，多饮水，保持尿液清洁。同时，要定期检查结石病情，避免疏忽长期不治疗。