伊犁河最珍贵的鱼类有裸腹鲟鱼(俗称黄鱼)、伊犁鲈鱼(俗称刺鱼)、银臀鳞鱼(又名银弓鱼、小白条鱼、黄鱼)。

裸腹鲟鱼可以被称为& quot祖先& quot鱼类，形成于新第三纪中新世，约250-2500万年前。如今，它仅存于里海、黑海和巴尔喀什湖，被誉为& quot活化石& quot专家对鱼的研究。伊犁河是该亚种鱼类在中国唯一存留的地方，一般体长1-2米，体重15-25公斤，体型非常大。

裸腹鲟鱼肉质丰富，鲜嫩可口，营养丰富。是国内外消费市场青睐的优良珍贵水产品。清代也是伊犁将军向朝廷进贡。

由于过度捕捞和产卵场的改变，伊犁河的极品鱼数量正在急剧减少，已被列为国家一级保护野生水生动物，严禁捕捞。

伊犁鲈鱼的银尾鳞、梭鱼的东方鲷、欧洲鲶鱼、散鳞镜鲤、皮鲤等。也是伊犁河的珍稀鱼类，有的是稀有品种，都以肉质细嫩鲜美而受到消费者的青睐。遗憾的是，它们的数量日益减少，分布范围也越来越小。

伊犁河流域有丰富的鱼类资源。鱼类约有32种，其中13种是土著鱼类，大多是冷水鱼。代表品种有银弓鱼、伊犁弓鱼、新疆裸重唇鱼、斑点重唇鱼、伊犁鲈鱼、短头鲶鱼等。移植的鱼类有26种，包括裸腹鲟鱼、西鲤、东方鲷、欧洲鲶鱼、红鲤等。

野生鱼种：鲤鱼、草鱼、鲶鱼、鲶鱼、银鲫、黑鱼等。

由于人类的过度捕捞和对鱼类产卵、繁殖和生存环境的人为破坏，鱼类资源衰退严重。

最珍贵的有弓头鱼、新疆裸重唇鱼、斑点重唇鱼、伊犁鲈鱼、短头鱿鱼，野生的不多。