线粒体呼吸作用是指细胞内线粒体利用氧气和有机物质进行氧化还原反应，产生能量并生成二氧化碳和水的过程。

1. 线粒体呼吸作用分为三个阶段：糖解阶段、三羧酸循环和氧化磷酸化阶段。

2. 糖解阶段：葡萄糖分子在胞质中被分解成两个分子的三碳糖，然后进入线粒体，通过一系列酶的作用被转化成乙酰辅酶A，同时产生少量ATP。

3. 三羧酸循环：乙酰辅酶A与氧化酶反应生成柠檬酸，经过一系列反应生成丙酮酸、苹果酸等中间产物，最终生成四氧化酸，同时也产生少量ATP。

4. 氧化磷酸化阶段：四氧化酸通过一系列酶的作用被还原成水和二氧化碳，同时释放大量能量，通过氧化磷酸化反应合成ATP。

5. 线粒体呼吸作用是细胞内最主要的能量来源，同时也产生二氧化碳和水，这些废物通过血液循环进入肺和肾脏排出体外。

需要注意的是，线粒体呼吸作用是一个复杂的过程，需要多种酶的参与，而这些酶的活性受到许多因素的影响，如温度、pH值等。同时，线粒体的功能异常会导致一系列疾病，如代谢性疾病、神经系统疾病等，因此需要重视线粒体的保护和修复。