眼睛内侧疼可能是由结膜炎、鼻窦炎、或睑板腺炎等原因引起的，详情如下：

1. 结膜炎：结膜是眼球表面的透明薄膜，如果被细菌、病毒感染或过敏等原因刺激，就会引起结膜炎。此时眼睛内侧会感到疼痛、灼热、发红、流泪等症状，可能伴随眼睑水肿和眼屎增多。治疗方法一般是使用抗生素或抗病毒药物，或者用眼药水缓解症状。

2. 鼻窦炎：鼻窦是头部的空腔，如果鼻腔和鼻窦发生感染或炎症，会引起鼻窦炎。此时眼睛内侧会感到疼痛、压力感或沉重感，可能伴随鼻塞、流涕、头痛等症状。治疗方法一般是使用抗生素、消炎药等药物，或者通过手术清除鼻窦内的分泌物。

3. 睑板腺炎：睑板腺是位于眼睑内侧的一种分泌脂肪的小腺体。如果睑板腺发生感染或堵塞，就会引起睑板腺炎。此时眼睛内侧会感到疼痛、热痛、沉重感等症状，可能伴随眼睑肿胀、红肿和分泌物增多。治疗方法一般是使用热敷、抗生素眼药水等药物，或者通过手术清除睑板腺内的分泌物。

除以上相对常见的原因之外，还有其他可能的原因，比如干眼症、近视等眼部疾病，或者颅内病变、颅内高压等全身性疾病，需要根据具体情况进行诊断和治疗。