生理期小腿疼可能是由月经痛、静脉曲张或深静脉血栓等原因引起的，详情如下：

1. 月经痛：月经期间，子宫收缩会引起疼痛，这种疼痛可以向下蔓延到小腿。此外，子宫内膜脱落会引起前列腺素释放，导致子宫收缩加强，疼痛加重。这种疼痛多数为周期性的、阵发性的，可以通过热敷、按摩、饮食调理等方式缓解。

2. 静脉曲张：静脉曲张是指静脉血管壁弹性下降，血管扩张、扭曲，形成静脉曲张。生理期间，子宫收缩会增加下肢的血液回流压力，加重静脉曲张症状。小腿疼痛、沉重、酸痛、水肿、静脉曲张突出等是静脉曲张的常见症状。预防方法包括穿着适当的袜子、多走动、避免久站久坐等。

3. 深静脉血栓：生理期间，子宫收缩会增加下肢的血液回流压力，如果此时下肢血流速度减慢，就容易形成深静脉血栓。小腿疼痛、肿胀、发热、皮肤发红等是深静脉血栓的典型症状，严重时可导致肺栓塞等严重后果。如出现上述症状，应及时就医。

除了以上相对常见的原因，生理期小腿疼还可能与神经、肌肉、骨骼等因素有关，如神经病变、肌肉劳损、骨折等。如果疼痛较为严重或持续时间较长，建议及时就医。