经常两三个月来一次月经可能是由多种原因引起的，常见的疾病包括多囊卵巢综合症、甲状腺功能减退、卵巢功能衰竭等。

1. 多囊卵巢综合症：多囊卵巢综合症是常见的内分泌疾病，主要表现为卵巢多囊、高雄激素血症和排卵障碍等。该病会导致月经不规律、延长或缺乏，甚至不来月经。在排除妊娠、子宫内膜异位症等其他原因后，多囊卵巢综合症是造成月经不规律的重要原因之一。

2. 甲状腺功能减退：甲状腺功能减退是一种常见的内分泌疾病，主要表现为甲状腺激素分泌不足。这会影响卵巢功能，导致月经周期延长或缺乏。此外，甲状腺功能减退还会导致体重增加、乏力、便秘等症状。

3. 卵巢功能衰竭：卵巢功能衰竭是指女性卵巢早期失去正常功能，造成激素水平下降。常见的病因包括遗传因素、放疗、化疗等。该病会导致月经周期延长、缺乏，甚至闭经。此外，卵巢功能衰竭还会导致骨质疏松、心血管疾病等。

除了上述常见原因外，还有其他原因也可能会导致月经不规律，如过度减肥、贫血、心理压力等。因此，如果出现月经不规律的情况，应及时就医，找到原因并给予相应治疗。