护垫上有咖啡色分泌物可能是由宫颈糜烂、子宫内膜异位症或子宫肌瘤等原因引起的，详情如下：

1. 宫颈糜烂：宫颈糜烂是由于宫颈上皮细胞受损而导致的炎症和出血。咖啡色分泌物是由于宫颈糜烂引起的宫颈炎症和出血，血液在经过阴道时被氧化而变成咖啡色。除了咖啡色分泌物，宫颈糜烂还可能伴有阴道瘙痒、分泌物增多等症状。

2. 子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜组织长在子宫外的疾病。咖啡色分泌物是由于异位子宫内膜组织在月经期脱落并引起的出血，血液在经过阴道时被氧化而变成咖啡色。除了咖啡色分泌物，子宫内膜异位症还可能伴有周期性腹痛、性交疼痛等症状。

3. 子宫肌瘤：子宫肌瘤是子宫平滑肌细胞生长异常形成的肿瘤。咖啡色分泌物是由于子宫肌瘤引起的子宫出血，血液在经过阴道时被氧化而变成咖啡色。除了咖啡色分泌物，子宫肌瘤还可能伴有月经量增多、经期延长等症状。

除了以上相对常见的原因，还有其他可能的原因，比如性传播感染、阴道炎等。如果出现咖啡色分泌物，建议及时就医，确诊病因并进行治疗。