月经干净后两天又有血可能是由以下原因引起的：子宫内膜异位症、宫颈糜烂、子宫肌瘤。

1. 子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜生长在子宫外的疾病。在月经期间，异位的内膜组织也会受到激素的影响，导致出血。由于异位的内膜组织在子宫外，出血无法顺利排出体外，容易引起疼痛和不适感。月经干净后两天又有血，可能是由子宫内膜异位症引起的。

2. 宫颈糜烂：宫颈糜烂是指宫颈表层上皮细胞脱落，暴露出了下层的柱状上皮，导致宫颈出血。宫颈糜烂的出血通常是鲜红色的，而且症状轻微，不会引起疼痛。月经干净后两天又有血，也可能是由宫颈糜烂引起的。

3. 子宫肌瘤：子宫肌瘤是一种常见的女性生殖系统肿瘤，多发生于40岁以上的女性。子宫肌瘤可以引起月经不调、经量过多等症状，也可以在月经结束后引起持续性的阴道流血。因此，月经干净后两天又有血，也有可能是由子宫肌瘤引起的。

除以上相对常见的原因之外，还有其他可能的原因，比如药物副作用、宫腔息肉、子宫颈癌等。如果出现类似症状，建议及时就医，进行相关检查和治疗。