怀孕三个月屁股骨头疼可能是由骶骨疼痛综合征、骶髂关节疼痛、坐骨神经痛等原因引起的，详情如下：

1. 骶骨疼痛综合征：怀孕期间由于子宫增大，骶骨关节处的肌肉和韧带受到挤压，加上孕激素作用，骶骨关节周围的软组织松弛，易发生骶骨疼痛综合征。主要症状为骶骨区域疼痛，有时放射至臀部和大腿后侧，甚至会影响行走和坐立。治疗方法包括物理疗法、按摩、针灸等。

2. 骶髂关节疼痛：怀孕期间，由于孕激素的松弛作用，骶髂关节周围的韧带变得松弛，容易引起疼痛。该症状的主要表现为臀部和骶骨区域的疼痛，有时会放射至大腿后侧，行走和坐立时加重。治疗方法包括物理疗法、按摩、腰带等。

3. 坐骨神经痛：怀孕期间由于子宫增大，压迫坐骨神经，加上孕激素松弛了骶骨周围的韧带和肌肉，容易引起坐骨神经痛。主要症状为臀部和大腿后侧疼痛，有时伴随着麻木和刺痛感，严重时甚至影响到行走和坐立。治疗方法包括物理疗法、药物治疗、伸展运动等。

除以上相对常见的原因之外，还有其他可能的原因，如骶骨骨折、盆腔炎症等。如果疼痛持续或加重，应及时就医。