新生儿哭的原因可能是由几种疾病引起的，分别为胃肠道问题、呼吸道问题和神经系统问题，详情如下：

1. 胃肠道问题：新生儿可能因肠绞痛、便秘、腹泻等胃肠道问题而哭闹不止。这些问题可能是由新生儿肠道未完全发育、喂食不当或感染等原因引起的。肠绞痛通常会伴随着腹部的紧张和腹泻，便秘则可能是因为喂养不当或肠道功能不良。腹泻则可能是由母体感染或进食不良造成的。

2. 呼吸道问题：新生儿可能因肺炎、支气管炎、哮喘等呼吸道问题而哭闹不止。这些问题可能是由母体感染、低出生体重、早产等原因引起的。肺炎和支气管炎会导致呼吸困难、咳嗽和发热等症状，哮喘则会导致呼吸急促和喘鸣等症状。

3. 神经系统问题：新生儿可能因脑积水、脑炎、脑损伤等神经系统问题而哭闹不止。这些问题可能是由胎儿期感染、窒息、缺氧等原因引起的。神经系统问题会导致新生儿出现呼吸困难、肌肉紧张、抽搐等症状。

除以上相对常见的原因之外，还有其他可能的原因，比如新生儿耳朵疾病、心脏病、肾脏疾病等。如果新生儿哭闹不止，需要及时就医，进行相关检查和治疗。