1.改善环境功能。保存完好的自然植被及其生态系统有助于水土保持、水源涵养、局部气候调节、正常生态过程和区域环境改善。特别是在生态系统脆弱地区建立的自然保护区，在环境保护中发挥着更加重要的作用。很多自然保护区都有茂密的原始森林，森林在涵养水源方面的作用是巨大的。森林可以防止雨水直接冲刷土地，降低地表径流的速度，给它缓慢渗透的机会。同时，森林可以吸收有毒气体，杀菌和阻挡灰尘。树木可以吸收低浓度范围内的各种有毒气体，使被污染的空气得到净化。

2.环境监测功能。自然保护区野生动植物种类繁多，是环境质量的指标。他们对空气、水文和植被的污染和破坏非常敏感。在固定地点观察自然保护区这些生物指标的危害程度，可以起到监测环境的作用。

3.科学修养。众所周知，人类社会看到的园林花卉、家畜家禽都是由自然界的野生物种培育驯化而来的。随着科学的发展，对一些珍稀动物或植物进行科学的培育和繁殖，为人类提供新的更优质的品种，也是自然保护区的一种实验活动。

4.宣传教育的作用。自然保护区是活的自然博物馆，是普及自然知识、宣传自然保护的重要场所。