酵母与酵母菌的主要区别是酵母是一种真核生物，而酵母菌是一种单细胞真菌。

1. 细胞结构：酵母是真核生物，其细胞结构复杂，包括有细胞核、细胞质和细胞壁等组成部分；而酵母菌是单细胞真菌，其细胞结构相对简单，没有细胞壁。

2. 生物分类：酵母属于真核生物界中的酵母门，属于真菌的一类；而酵母菌属于真菌界中的酵母菌门，是真菌的一种。

3. 生活环境：酵母广泛存在于自然界中，可以在空气、土壤、水体等各种环境中找到；而酵母菌主要生活在植物表面、果实、发酵食品等特定环境中。

4. 代谢方式：酵母利用发酵代谢产生能量，可以进行无氧呼吸或乳酸发酵；而酵母菌可以进行呼吸作用，进行有氧呼吸产生能量。

5. 应用领域：酵母广泛应用于食品工业、酿酒业等领域，如面包发酵、啤酒酿造等；而酵母菌主要应用于食品工业中的发酵食品制作，如酱油、酱菜等。

需要注意的是，酵母和酵母菌虽然有不同的分类，但它们在产生发酵作用、促进食品发酵等方面具有相似的功能。同时，酵母菌也是一种广泛存在于环境中的微生物，具有重要的生态和经济价值。