囊性畸胎瘤和实性畸胎瘤的主要区别是前者主要由囊性结构组成，后者则由实性结构组成。

1. 组织结构：囊性畸胎瘤是由多个囊泡组成的肿瘤，囊泡内充满液体或半固体物质，具有明显的囊性结构；实性畸胎瘤则是由实性组织构成，没有囊泡结构。

2. 影像学表现：在影像学检查中，囊性畸胎瘤呈现为多个囊泡状阴影，囊内可能有液体、脂肪或骨化等成分，而实性畸胎瘤则表现为均匀的实性肿块。

3. 组织学特点：囊性畸胎瘤的囊泡内含有不同类型的组织，如皮肤、毛发、牙齿等，而实性畸胎瘤则主要由多种胚胎组织构成，如神经上皮、软骨、脂肪等。

4. 发生部位：囊性畸胎瘤通常发生在卵巢或睾丸等处，而实性畸胎瘤则可以发生在任何部位，如中线器官、脑部、胸腔等。

5. 临床表现：囊性畸胎瘤多数为良性肿瘤，临床症状轻微，常无明显不适；而实性畸胎瘤可以是良性或恶性肿瘤，临床症状较为明显，如腹痛、呕吐等。

需要注意的是，囊性畸胎瘤和实性畸胎瘤都属于畸胎瘤的范畴，是一种由多种胚胎组织构成的肿瘤。囊性畸胎瘤和实性畸胎瘤的治疗方法和预后也有所不同，因此在临床上需要准确诊断并选择合适的治疗方案。