无创DNA和羊水穿刺的主要区别在于采样方式不同。

1. 采样方式：无创DNA是通过抽取孕妇血液中的游离胎儿DNA进行分析，而羊水穿刺是通过将一根细长的针插入孕妇的腹部，抽取羊水进行检测。

2. 风险程度：无创DNA相对来说风险较低，因为只需要进行血液采样，不会对胎儿或孕妇造成太大的创伤和风险；而羊水穿刺则较为侵入性，可能会引起感染、胎儿损伤、流产等风险。

3. 检测范围：无创DNA主要用于筛查染色体异常和遗传疾病，如唐氏综合征等，而羊水穿刺除了可以进行染色体异常和遗传疾病的筛查外，还可以进行胎儿畸形、神经管缺陷等问题的检测。

4. 时间点：无创DNA通常在怀孕9-10周后可以进行，而羊水穿刺一般在怀孕16-20周进行。

需要注意的是，无创DNA虽然风险较低，但仍有可能存在假阴性和假阳性的情况，如果结果显示有异常，通常需要进行进一步的确认性检测。而羊水穿刺虽然能够提供更准确的结果，但由于风险较高，一般只在无创DNA结果显示存在问题或高风险时才会选择进行。在选择进行无创DNA或羊水穿刺时，孕妇应与医生充分沟通，权衡利弊，做出最合适的决策。