唐氏筛查无创DNA和羊水穿刺的主要区别在于前者是一种无创的筛查方法，而后者是一种有创的诊断方法。

1. 安全性：唐氏筛查无创DNA是通过抽取孕妇血液中的胎儿游离DNA进行检测，无需直接接触胎儿，因此相对安全。而羊水穿刺需要通过穿刺子宫壁和胎儿腹壁，存在一定风险，如感染、流产等。

2. 检测时间：无创DNA筛查通常在孕妇怀孕9周后进行，结果需要几天到几周的时间才能出来。而羊水穿刺一般在孕妇怀孕16周后进行，结果可以在几天内出来。

3. 检测对象：无创DNA筛查适用于所有孕妇，而羊水穿刺一般只适用于高风险孕妇，如年龄较大、有家族遗传病史等。

4. 检测范围：无创DNA筛查主要用于检测唐氏综合征等常见染色体异常，而羊水穿刺可以检测更多的染色体异常、基因突变和某些遗传疾病。

5. 误诊率：无创DNA筛查的误诊率相对较高，可能会出现假阳性或假阴性结果。而羊水穿刺的准确性相对较高，误诊率较低。

6. 适用时期：无创DNA筛查可以在任何孕期进行，而羊水穿刺一般在怀孕16周后才能进行。

需要注意的是，无创DNA筛查虽然是一种无创的方法，但仍然有一定的误诊率，如果筛查结果为高风险，还需要进行进一步的确诊检查，如羊水穿刺。因此，在进行唐氏筛查时，孕妇应该充分了解相关知识，做出明智的决策。同时，无论是无创DNA筛查还是羊水穿刺，都应该由专业医生进行操作，以确保安全和准确性。