9岁维生素D缺乏症的主要表现是骨骼发育异常、肌肉无力和疲劳，详情如下：

1. 骨骼发育异常：维生素D是促进钙和磷的吸收和利用的重要营养素，缺乏维生素D会导致骨骼发育不良。这种症状表现为骨骼畸形、生长迟缓和身高矮小等。维生素D缺乏会影响钙的吸收和骨骼的矿化，导致骨骼结构脆弱，容易发生畸形和受伤。

2. 肌肉无力：维生素D缺乏会导致肌肉功能受损，表现为肌肉无力和肌肉酸痛。维生素D参与调节肌肉收缩和松弛过程中的钙离子交换，缺乏维生素D会导致肌肉功能受影响，产生肌肉无力的症状。

3. 疲劳：维生素D缺乏也可能导致疲劳感。维生素D参与能量代谢和免疫调节，缺乏维生素D会影响能量的产生和利用，导致机体出现疲劳感。

除了上述相对常见的症状外，还可能出现其他症状，比如免疫功能下降、易感染和注意力不集中等。维生素D在免疫系统中发挥重要作用，缺乏维生素D会影响免疫功能，使机体容易受到感染。此外，维生素D也与神经系统的发育和功能密切相关，缺乏维生素D可能会影响注意力和学习能力。但这些症状相对较少见，常见的主要表现仍是骨骼发育异常、肌肉无力和疲劳。