蒋介石来到台湾后，秉持着“一切为蒋经国上位铺路”的方针，迅速展开了对各大机构的洗牌与调整。那些曾经的死敌如阎锡山、白崇禧等人自然迅速被排挤出局，而即便是一些忠诚的老部下，蒋介石也毫不留情，实施了大规模的权力更迭。

毛人凤，这位曾长期掌控情报工作的保密局局长，虽然为蒋介石效力多年，但如今却成了蒋介石手下的一颗“棋子”。蒋介石任命蒋经国为“国防部总政治部主任”，逐步接管台湾的情报工作，这一变动让毛人凤感到了前所未有的危机。他被视为“笑面虎”，一生以忍耐和隐忍为人称道，许多人将他与历史上的司马懿、德川家康相提并论。但这次，蒋经国要接手他多年心血的情报系统，令他再也忍受不了。于是，毛人凤不断在背后设置障碍，处处给蒋经国制造麻烦，让蒋经国在情报界的运作步履维艰。

两人之间的权力角逐逐渐升级，彼此都在寻求打败对方的机会。在这一过程中，一系列的冲突不断爆发，最终的结局不言而喻：毛人凤最终惨败，蒋经国迎来了胜利。

他们之间的首次大冲突发生在著名的“毛邦初事件”中。毛邦初，蒋经国的表兄和心腹，1952年被派往美国，以“空军副司令”的身份驻扎美国，表面上是谈判空军军购，实际上则负责游说美国，推动共和党胜选。蒋介石十分渴望共和党获胜，因此决定全力支持。就在此时，接连发生了一些意想不到的事情。

美国共和党议员诺兰访问台湾，并提出希望由自己主持台湾的军购事务，蒋介石立刻答应了他的请求，将这一重任交给了诺兰。然而，军购本是一个利益丰厚的项目，蒋介石的决定让毛邦初心生不满。没多久，诺兰发现毛邦初经手的军购账目不对，少了150万美元。蒋介石对毛邦初产生疑虑，要求将所有军购款项交由诺兰管理。这让毛邦初意识到自己的处境愈发危险，权力即将丧失。他决定采取对抗的策略，公然宣称自己是由李宗仁代总统任命的，蒋介石无权剥夺他的职务。

很快，毛邦初把近5000万美元的军购款项提走，飞往墨西哥，彻底与蒋介石撕破了脸皮。他还向媒体披露了蒋介石支持共和党、进行院外游说、收买诺兰等细节，激起了美国舆论的强烈反应。此事在美国引发轩然大波，蒋介石的行为遭到激烈批评，甚至成立了专门调查小组来审查此事。

毛邦初事件的风波，使得蒋经国刚刚接手的情报工作陷入困境，声誉扫地。蒋经国的亲信毛人凤则认为这是他打击蒋经国的良机，便将毛邦初案件的详细情况上报给蒋介石，希望借此证明蒋经国无法胜任情报工作的领导职务。然而，蒋介石尽管批评了蒋经国的处理不当，却并未因此对其失去信心，反而依然对蒋经国充满信任。毛人凤的如意算盘最终没有得逞，他不仅未能削弱蒋经国的地位，反而因为过于激烈的对抗犯了大忌——“疏不间亲”。

毛邦初事件过后，蒋经国对毛人凤产生了极大的敌意，他开始寻找方法彻底铲除毛人凤的势力。此时，蒋经国找到毛人凤的死对头郑介民寻求帮助。郑介民曾在多年前被毛人凤陷害，失去了保密局局长的位置，深知毛人凤的威胁。在蒋经国的支持下，郑介民建议将保密局“收归国有”，并且建立培训班培养新一代情报力量，同时将保密局与内调局（前身为党通局和中统）合并。郑介民的这一建议意在打破这两个强大派系的势力，彻底削弱毛人凤和陈立夫的权力根基。

陈立夫虽然与蒋介石关系密切，并且早已预见到蒋经国接班的事实，因此早早地退出了权力斗争。然而，毛人凤并没有意识到形势的变化，他依然顽固地坚持着自己的位置。在蒋经国宣布这一决定时，毛人凤冷静回应说：“情报工作是非常专业的工作，外行是不能领导的。”蒋经国表面冷静，但内心早已决定要将毛人凤一举剔除。

不久后，毛人凤自己给蒋经国送来了机会，这就是“杜长城事件”。杜长城是毛人凤的重要手下，这个与毛邦初一样背景复杂的人，趁着大撤退和军事演习期间牟取私利，涉嫌贪污走私。蒋经国决定借此机会铲除杜长城，以此削弱毛人凤的影响力。然而，审讯过程中，蒋经国惊讶地发现，杜长城竟然策划了绑架蒋经国的阴谋。原来，杜长城企图通过绑架蒋经国，再由毛人凤出面营救，这样既能提升毛人凤的形象，又能让蒋经国成为无法保护自己的笑柄。

然而，杜长城的阴谋未能得逞，蒋经国便顺利捉住了他。蒋介石得知此事后非常愤怒，指示将所有参与此案的保密局人员“一律枪毙”。这一事件直接加速了毛人凤的陨落，在杜长城事件后，他彻底失去了在政坛的立足之地。不久后，毛人凤被诊断出患有肝癌，蒋介石趁机将他送往美国治疗。

通过毛邦初事件和杜长城事件，蒋经国与毛人凤的权力博弈展示了两个截然不同的结局。一个是“太子”，一个是“家奴”，他们之间的差距，不仅仅是职位的高低，更是权力和影响力的天壤之别。

1955年11月，毛人凤在台湾“三军总医院”去世，蒋介石对此反应冷淡。毛人凤的妻子曾找到宋美龄哭诉，最终蒋介石同意为他写下一副挽联。